自打当年轩辕黄帝指白猿而留技艺之后，天下武林便流传出各式各样神奇的武学，江湖之上更是能人辈出，北宋年间有与一僧二挂三老四绝十大高手，个个皆有通天彻地的本领。辗转到了南宋时期，天下五绝横空出世，东邪、西毒、南帝、北丐、中神通可谓无人不知无人不晓。提及华山五绝，没人会忘记那位独霸桃花岛，傲视群雄的黄药师。
所谓“桃花影落飞神剑，碧海潮生按玉箫。”东邪黄药师能文能武，天下诸般技艺集一身，可谓是金庸笔下的全才，此人智商极高，若在现代，不是科学家就是文化界大咖。最难能可贵的是，黄药师这个人不仅才华多，而且武功极高，天下单打独斗能够伤黄药师之人寥寥可数，他是唯一一个将奇门术数与武学联系在一起的绝世高手，一夫当关万夫莫开！
然而如此传奇的人物，自打第三次华山论剑后便彻底消失不见，武林中从未传出黄药师的结局，他仿佛人间蒸发了，到底发生了什么事情呢？
众所周知，杨过打死蒙哥后，过了十三年左右忽必烈再度卷土重来，襄阳城终于挡不住蒙古的铁蹄，郭靖、黄蓉夫妇最后还是死在了这座他们守卫了数十年的古城中，结合小说内容记载来看，黄药师最后也可能死在了襄阳城。
咱们首先看看黄药师多疼爱黄蓉，郭靖、黄蓉隐居桃花岛后黄药师便搬了出去，他不习惯与女儿、女婿住在一起。这人性格很怪，明明关心女儿，却又不想见女儿，如《神雕》中有这样一段原文——他不愿给女儿瞧见，只远远跟着，直至见一灯和周伯通分别和金轮国师动手不胜，这和尚真是生平难遇的好手，不禁见猎心喜，跟着出手。
小说里黄药师出场次数不多，每次都因黄蓉一家子有难他才出现。他第一次现身是在嘉兴，因为见到双雕所以赶来救难；第二次现身是在英雄大会，他特意赶过来打算助女儿一臂之力；第三次现身是在二次英雄大会，黄药师再度亮相，原因是他担心烟波钓叟、神雕侠（他当时不知道是杨过）等人对郭靖、黄蓉不利；最后一次是在绝情谷附近，他再次因为见到双雕而赶来帮忙，之后便和黄蓉、一灯大师等人闯蒙古军营回到襄阳城助郭靖抗击蒙古大军。
黄药师虽然神龙见首不见尾，但只要听闻女儿一家子有难，便会及时现身，最后一次襄阳围城，郭靖、黄蓉受困于襄阳城中，黄药师听到这样的消息岂能不来？
新修版《倚天》中记载郭靖、黄蓉所藏秘籍中包括黄药师的武功，并且黄药师还特意耗费心血创造了一门可以速成的《九阴真经》的武学，他们担心后世英雄人物得到以后无法及时修炼，因此发明速成版让他们快一点提高自己的实力，灭绝师太曾叮嘱周芷若先学速成版，可见这是郭靖、黄蓉叮嘱给郭襄的，郭襄后来又交代给自己的传人，历代口口相传而来。
所以咱们可以发现，黄药师参加了“倚天屠龙计划”，既然他参加了这项计划，那么最后的襄阳保卫战他也会参加，以黄药师的性格，岂能独自离开苟且偷生于这个世界？
襄阳城破，郭靖、黄蓉双双殉难，郭破虏也战死了，作为黄蓉的父亲，作为武林中天不怕地不怕的东邪，他岂能脱身？岂能弃女儿、外孙于不顾？由此咱们基本可以断定，黄药师最后陪黄蓉一起就义于襄阳城中，被蒙古乱军所杀。